一、彻底清塘。除去过多淤泥，并用20千克/亩～30千克/亩生石灰或水霉净0.3克/立方米～0.5克/立方米或用灭菌净水液200毫升/亩全池泼洒。
二、合理控制种苗放养密度，特别是具有硬棘、硬刺的水产动物。
三、拉网运输和放养种苗时操作要细致，不使鱼体受伤，最好用水霉净50克/立方米浸泡15分钟～20分钟，可避免水霉病、鳃霉病的发生。
四、加强饲养管理，提高种苗自身免疫力和抵抗力。每10千克水产动物用0.3克～0.6克维生素E，每天喂2次，连喂3天。
（1）防寒防冻，保持良好水质，适时杀虫，在拉网和运输过程中避免损伤，并及时消毒杀菌。拉网后全池泼洒“聚维酮碘”。
（2）保持良好水质，孵化环（缸）进出口用60目网片过滤。
（3）亚甲基蓝1.5-2.Omg/L浸泡，每天1次，连续2-3次，换水1/2以上。
（4）五倍子末0.3-0.5mg/L，每天1次，连续2-3次，每天换水1/3左右。
（5）用2%-3%的食盐水浸洗5-10min，或用1%食盐水加食醋数滴浸泡5min。
水霉病的防治方法：1、可以用含碘消毒剂浸泡，如浓度为20mg/L聚维酮碘溶液，或2mg/L的高锰酸钾混合1%的盐水浸泡病鱼20~30分钟;
2、或用800mg/L的食盐与小苏打合剂(1:1)全池泼洒;
3、或内服抗菌药物(如磺胺类)，防治细菌激发感染。