跨省转院手续办理流程：
1、在住院前或住院后3日内打老家新农合咨询电话，对住院就医情况进行登记备案；
2、出院后，在居住所在地由街道办事处或居委会出具一份居住证明；
3、如果是从参合所在地直接到省外住院化疗，必须在走之前办理转诊转院手续。
法律依据： 《中华人民共和国社会保险法》第二十九条 参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。 社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
各级医院起付线从100-1500元各不相同。为合理控制医疗费用，住院医药费设立起付线。
市内一级定点医疗机构，起付线100元;市内二级定点医疗机构,起付线500元;市内三级定点医疗机构，起付线800元,其中职工医院起付线450元；市外定点医疗机构起付线为900-1500元。住院补偿起付线在补偿范围内扣减,并不予补偿。
1、由转出医院主诊医师填写《某地城镇职工基本医疗保险参保人员统筹区内转诊市内转院申请表》或《某地社会医疗保险参保人员统筹区内转诊转院申请表》由副主任医师以上人员或科主任签字，医院医务（医保）部门联系转入定点医疗机构并盖章。
2、由转出医院结算处凭《市内转院申请表》，在医保信息系统为参保病人办理出院结算，在医保信息系统进行转诊市内转院申请登记，并与拟转入定点医疗机构联系，经对方在医保信息系统中确定。
3、由市医保二级经办机构1个工作日内在医保信息系统办理备案手续。定点医疗机构通过医保信息系统打印有备案结果的市内转院申请表一式两份，一份交病人在转入定点医疗机构住院处办理转入住院登记，一份留存备案。