首先，益生菌最好在空腹时服用，这样可以最大程度地提高吸收效果。其次，建议每天坚持用同一品牌的益生菌，因为不同品牌的菌株可能会有不同的效果。另外，在服用益生菌期间，可以注意饮食结构，适量地摄入膳食纤维和水分，帮助营养物质的吸收。最后，长期坚持服用益生菌，才能获得持久的改善效果。
益生菌是活菌制剂，所以它的最适宜温度大概37摄氏度左右，使用温水冲泡会有效保持它的活性，水温最好在40摄氏度左右。如果水温过高，则会导致益生菌丧失其活性。
益生菌可以选择饭后20~30分钟服用，在服用的时候，尽量37度以下的温开水冲服。
1.益生菌尽量低温冷藏或者恒温25℃干燥保存。
2.如果是冷藏，取出之后需要直接食用，不可高温加热，因为益生菌的活性会随着温度升高而提升并进入发酵过程，且容易造成产品口味变化。